王志勇：以“临床科研一体化”为核心的研究型医院建设“长海模式”

近年来，上海长海医院在建设研究型医院的道路上积极探索，通过建设大数据科研平台和研究型单病种数据中心，在构建“临床科研一体化”方面取得了显著成效，为研究型医院建设迈出了坚实的一步。

2020年12月19日，在中国研究型医院学会医疗信息化分会举办的“医疗大数据应用与智慧医疗高峰论坛”分论坛上，上海长海医院信息科主任王志勇介绍了该院以“临床科研一体化”为核心的研究型医院建设“长海模式”。

王志勇首先介绍了该项目的背景：一是“学校双研项目（2017年-2019年）”：建设研究型科室、培养研究型医生，其中一个重要方向是建设研究型单病种；二是“医院临床研究中心建设（2020年-2022年）”，上海长海医院由上海申康医院发展中心（简称：申康中心）代管，申康中心正在如火如荼地建设临床研究中心，并单独成立了“临床研究中心”部门，预计将在2022年全面建成，包括场地、设备、人员、成果转化机制等。上海长海医院是临床科研数据库建设试点医院，要求建设单病种科研数据库。

建设目标是要实现“科研大数据的采集、分析和利用”。具体而言，要建立研究型单病种数据中心，形成长期、动态、连续、大规模、日趋完善的数据积累，支撑科研工作的数据采集，结合临床科研一体化数据采集方式，做到诊疗数据与科研数据的同步、同源采集，确保数据的完整、准确，有助于丰富的临床病例资源转化为宝贵的医学研究资源。

“临床科研一体化”是实现原则，王志勇介绍，目的是要利用结构化电子病历，结合辅诊结构化报告改造，进行科研数据采集，结合单病种数据中心，帮助医生对数据进行分析利用。

“建设研究型单病种数据中心，是落地‘临床科研一体化’的关键一步。在建设单病种科研数据库的过程中，一定要充分调动临床的积极性，充分发挥临床的智慧。”王志勇谈道，建设任务主要包括三方面：

一是科研数据来源分析，主要来自电子病历（病程记录和手术记录）、病理结果、检查报告、门诊随访记录等，共有300-500个研究要素项；

二是数据采集，涉及病历、检查报告等核心系统的改造，数据采集之后放在科研数据中心（RDR）；

三是建立研究型单病种数据中心，让医生便捷地得到CRF（Case Report Form，病例报告表）数据；建成支撑学科发展的科研单病种库，共享病种资源，形成科研数据“采集-搜索-统计”一体化应用。

以“胰腺癌单病种数据库”为例：

首先，临床医生确定7张结构化数据表单，包括：患者一般信息、检验资料、检查资料、入院记录、手术记录、并发症情况和病理结果等，每个表单都是结构化的。

然后，进行数据来源分析。胰腺癌单病种数据库的数据来源包括：检验资料150项，占总数据来源的28%；病史资料150项，占28%；病案首页100项，占18%；手术记录60项，占11%；病理资料40项，占7%；检查资料30项，占5%；辅助检查15项，占3%。

接下来就是系统改造。“完成数据来源分析后，我们就知道要从哪些系统采集数据、要改造哪些系统，心里就有数了。”王志勇介绍。系统改造一方面是电子病历系统改造，包括住院电子病历和门诊电子病历。要把住院电子病历改造成颗粒度很细的、结构化的、科研型电子病历。“根据科研需求设置了必填项，如果不填就无法保存。”此外，针对门诊随访开发的门诊科研电子病历，泌尿外科医生可以在门诊进行数据采集。另一方面是辅诊报告结构化改造，包括病理、影像、窥镜等检查报告前结构化改造。

之后是住院科研病例入组，将科研病例入组、出组的流程与临床诊疗工作结合，通过ICD-10编码，规范入、出组流程。

1．科研大数据平台

建成了科研大数据平台，包括人群筛选、人群管理、人群分析、数据挖掘、数据质控、研究建模、数据导出和系统管理。

目前已有4个病种纳入上海长海医院科研病种管理，总入组例数7148例，包括：胰腺癌病种、膀胱癌病种、结直肠癌病种、慢性胰腺炎病种。eCRF与科研病历之间要做到：要素一致、字典统一、数据一致。

2．搜索引擎

后台可以监控到哪些科室、哪些医生搜索了哪些内容。目前，周均使用1500余人次，已通过系统导出近60万条患者就诊记录，近40G数据。

3．高分论文

基于大数据平台，上海长海医院构建了“胰腺癌术后感染风险预测模型”，为临床制定预防和干预措施提供依据，并在Nature子刊上发表了高分论文《一个基于实验室大数据用于胰腺癌早期诊断和鉴别诊断的机器学习模型》，科研数据中心（RDR）应用成效初显。

1．扩大试点科室范围

前期已有4个科室及病种参与临床科研一体化建设项目，包括胰腺外科（胰腺癌）、消化科（慢性胰腺炎）、肛肠科（结直肠癌）、泌尿外科（膀胱癌）。下一步拟在此基础上扩建4个科室及相关病种：神经外科（脑卒中）、脑血管外科（动静脉畸形、动脉瘤）、神经内科（脑梗死）、中医肿瘤科（原发性肝癌中医治疗），将更多的科室和病种纳入平台。

2．完善科研数据采集质控体系

针对科研数据采集存在数据丢失、数据不全、环节缺陷等问题，要进一步完善科研数据采集质控体系。据介绍，上海长海医院的AI病历内涵质控系统已完成上线，AI病历内涵质控系统可实现：病历缺陷提醒、环节质控提醒、专科质控、终末质控、核心病历筛查等。“最终提升数据质量，提升科研水平。”王志勇强调。

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