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完蛋!审稿人竟对我的 qPCR 结果提出这么多要求 (附解决方案)

生物学霸 2023-01-28

师弟

师兄,我现在很发愁。目前文章接收的拦路虎在 qPCR 实验结果这部分,我没想到要求会这么严格,我要延毕了......

审稿人具体是什么样的要求呢?

师兄

师弟

一位审稿人特别严谨,按照 MIQE 指南要求我提供必要的实验和数据处理细节(实验设计、样本、核酸提取、反转录、靶基因、qPCR 引物、探针、qPCR 验证和数据分析)。我的 qPCR 实验并不完美,虽然 CT 值在可接受范围内,但扩增曲线不尽人意。正常的 qPCR 扩增曲线一般呈 S 型,我的部分实验图曲线异常,出现了平台期下降,我怕是解决不了这个问题。

这个问题我帮你解决,你可以先申请延长回复审稿意见,我们一起尽快完善 qPCR 实验。 

师兄


为帮助大家了解 qPCR 流程,完成优质的 qPCR 实验,2022 年 12 月 7 日(周三)14:00~15:00 ,Bio-Rad 资深应用专家余小菁将带来主题为【如何设置基于 qPCR 的基因表达分析实验 —— 从样本到结果】的在线课程直播。


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实时荧光定量 PCR(qPCR)技术几乎贯穿了现代分子生物学的历史,广泛应用于病原微生物、疾病诊断、动植物、遗传育种、细胞生物学等领域,对于推动生命科学的进步,具有举足轻重、承上启下的作用。早在 2009 年,行业资深科学家制定 qPCR 实验最低信息标准 MIQE,即在文章投稿时需要同时提交一份检查清单,由 9 部分组成,共 85 个参数,以确保 qPCR 实验的实用性、准确性、和可重复性。


图 1:来源 NCBI


如该流程图所示,其囊括了 qPCR 实验所有的实验步骤,但以下实验步骤科研人都全面掌握了吗?qPCR 实验如若掌握不到位,轻则拖沓实验进度,无法获取有效数据,可能会引起导师的不爽,重则导致文章达不到行业金标准,无法顺利见刊,有延期毕业之风险。


图 2. qPCR 实验步骤流程图


【「伯」采众长,解密基因】专题研讨会,带你系统的了解整个基因表达分析实验流程,以及关键节点,如 assay 的建立、验证与优化、qPCR 数据分析等,我们真诚为大家分享完善的、科学的、全流程符合 MIQE 指南的 Bio-Rad 解决方案。


在此我们先选取 3 个代表性的问题以及解决方案,做一个小小的预告,后续精彩内容和细节详见专题网络研讨会:


问题 1:如何完善基因表达分析流程,得到准确可靠的 qPCR 数据?


解决方案:良好的实验设计和 RNA 质量是实验成功的基础,之后选择合适的参考基因进行相对定量分析,结合合适的统计方法(t 检验、方差分析 ANOVA),多管齐下为实验保驾护航。


问题 2:qPCR 实验重复性差怎么办?


解决方案:除了要关注 qPCR 实验生物学重复性,做好样品处理与质量控制,也要注意 qPCR 实验常会存在批次效应,复孔重复性差,大多因为加样误差导致,建议移液器定期校准,同时可通过扩大反应体系或提前配制好预混液。


问题 3:想要完美的 qPCR 实验结果需要重视哪些方面?


解决方案:qPCR 实验在实验设计、样本、核酸提取、反转录、靶基因、qPCR 引物、探针、qPCR 验证和数据分析等九大模块中都会遇到阻碍,本课程针对各个步骤,非常详细地介绍了解决这些困难的要点,帮助大家获得完美的 qPCR 实验结果。



注:
1.相关产品仅限科研使用,不作为临床诊断;
2.Bio-Rad 是 Bio-Rad Laboratories,Inc 在特定区域的商标。



内容策划:王丹琦
内容审核:钟可可

题图来源:丁香园论坛


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