《自然·医学》：食物过敏，肠道菌群逃不了干系 | 热心肠日报
今天是第990期日报。
Nature子刊：肠道菌群可介导婴儿的牛奶过敏
Nature Medicine[IF:32.621]
① 给无菌小鼠移植婴儿粪菌，健康婴儿的菌群可预防小鼠发生牛奶过敏（CMA），而CMA婴儿的菌群无此保护作用；② 58个OTU在健康和CMA婴儿粪便中存在丰度差异，受体小鼠粪菌中也有相似差异；③ 两组小鼠的回肠上皮细胞基因表达不同，回肠菌群组成的差异与粪便菌群相似，提示回肠细菌可能调控宿主代谢和免疫从而影响食物过敏；④ 分析回肠差异性表达基因和菌群OTU的关系，结合单一定植实验，鉴定出产生丁酸的梭菌属粪厌氧棒状菌对CMA起保护作用。
Healthy infants harbor intestinal bacteria that protect against food allergy
01-14, doi: 10.1038/s41591-018-0324-z
【主编评语】西方社会中，食物过敏的发生率在近几十年显著上升。Nature Medicine发表的一项最新研究，通过小鼠粪菌移植和关联性分析，证实肠道菌群可调节小肠基因表达、影响宿主的牛奶过敏易感性，并鉴定出产生丁酸的梭菌属细菌——粪厌氧棒状菌（Anaerostipes caccae）可对牛奶过敏起保护性作用。该研究为菌群与食物过敏的因果性关系提供了关键证据，说明靶向菌群治疗食物过敏的疗法具有可行性。（@mildbreeze）
Science新闻：肠道菌群，你的微生物“生命之钟”
Science[IF:41.058]
① 研究者使用机器学习分析了1165名健康人的3600多个肠道菌群样本，初步锁定了90%样本中均含有的95种细菌；② 其中有39种细菌与年龄预测明显相关，算法预测的年龄可精准到4岁以内；③ 随年龄增加，霍氏真杆菌等变得丰富，而与溃疡性结肠炎相关的普通拟杆菌会减少；④ “菌群老化时钟”不仅能预测人体年龄和衰老速度，也可用于研究饮食、抗生素等物质对人体衰老和健康的影响；⑤ 这种菌群时钟特征的普遍性，以及其与衰老的因果关系，仍需深入研究。
The bacteria in your gut may reveal your true age
01-11, doi: 10.1126/science.aaw6459
【主编评语】Science上周发表的新闻对bioRxiv上一项预印版的研究进行了报道（https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/28/507780），该研究通过机器学习算法可通过分析肠道菌群组成预测人体年龄，误差在4岁以内，或许可作为标志物用于衰老相关研究。虽然因果性仍待更多研究阐明，但肠道菌群与衰老之间存在密切关联已无法否认。（@mildbreeze）
Nature子刊：NLRP12在细菌耐受和病原体定植抵抗中的双面作用
Nature Communications[IF:12.353]
① 单核细胞中，NLRP12可螯合分子伴侣HSP90，阻断其对NOD2的稳定作用，促进NOD2被蛋白酶体降解，从而增强对细菌胞壁酰二肽（MDP）的耐受性；② NLRP12核苷酸结合结构域邻近的连接区，介导了NLRP12与NOD2的互作；③ NLRP12基因缺陷无法抑制MDP诱导的NF-κB和随后的JAK/STAT信号通路活性；④ 从而使单核细胞丧失对MDP的耐受，增强NOD2介导的炎性单核细胞募集，伴随肠上皮中干扰素刺激基因表达升高，使小鼠对鼠柠檬酸杆菌的肠道定植有更强的抗性。
Proteasomal degradation of NOD2 by NLRP12 in monocytes promotes bacterial tolerance and colonization by enteropathogens
2018-12-17, doi: 10.1038/s41467-018-07750-5
【主编评语】NLRP12基因缺陷可引起一种周期性浆膜炎的自身免疫病，Nature Communications发表的一项研究发现，NLRP12经泛素-蛋白酶体通路讲解NOD2，促进单核细胞对细菌的耐受性，而其基因缺陷可使单核细胞丧失对细菌分子的耐受性，增强自身炎症疾病的同时，也提高了对粘附性肠道致病菌的定殖抗性。可以说，粘附性的肠道致病菌利用了宿主对共生菌群产生免疫耐受的机制，来促进自身的定殖和感染。（@mildbreeze）
Nature子刊：环境中的抗性基因主要来源于粪便污染
Nature Communications[IF:12.353]
① 经处理的污水排放导致抗生素耐药菌、抗性基因和抗生素残留释放到环境中；② 利用crAssphage(在人类粪便中异常丰富且具有特异性的噬菌体)序列作为人类粪便污染的标志物，分析公共可用宏基因组数据中相对抗性基因的丰度和伴随的粪便污染程度；③ 抗性基因的存在很大程度上可用粪便污染来解释，除生产过程中产生的高浓度抗生素污染的环境外，在环境中无明显的选择迹象；④ 有必要考虑粪便污染水平，以避免对抗生素抗性的环境选择做出错误假设。
Fecal pollution can explain antibiotic resistance gene abundances in anthropogenically impacted environments
01-08, doi: 10.1038/s41467-018-07992-3
【主编评语】污水处理并不能完全消除其中的抗性基因，处理后的净水排放到环境中仍然可能会导致抗性基因的扩散。为了区分净水排放和环境选择等因素对于抗性基因富集的贡献，作者巧妙的选用了人粪便标记物crAssphage，对现有的宏基因组进行数据挖掘，最终明确了环境中抗性基因主要是粪源输入的结论。（@gaoch）
Gut：IBD女性产后发生精神疾病的风险升高
Gut[IF:17.016]
① 纳入3721名炎症性肠病（IBD）和近80万名无IBD的女性进行研究；② IBD和无IBD女性中，分别有22.7%和20.4%在妊娠及产后一年内诊断为新发精神疾病，前者风险上升12%，特别是情绪或焦虑障碍和酒精或药物使用障碍；③ 新发精神疾病风险在产后和克罗恩病人群中升高，而非孕期和溃疡性结肠患者；④ IBD女性产后精神疾病风险与年龄、分娩年份、医疗合并症、产前检查次数、家庭医生产科护理和婴儿死亡率有关。
Inflammatory bowel disease and new-onset psychiatric disorders in pregnancy and post partum: a population-based cohort study
2018-12-08, doi: 10.1136/gutjnl-2018-317610
【主编评语】Gut近期发表一项加拿大的队列研究，发现患有炎症性肠病（IBD）的女性发生产后新发精神疾病的风险上升，提示应对该人群进行更多追踪和关注，以便早预防、早发现、早干预。（@mildbreeze）
菌群产生的丁酸抑制小肠表达IDO-1的双重机制
Frontiers in Immunology[IF:5.511]
① IDO-1是小肠上皮细胞（IEC）产生的调节免疫应答的因子，对肠道稳态很重要；② 分析401种共生菌的单菌培养物，发现丁酸是控制IEC表达IDO-1的主要代谢物；③ 丁酸对IDO-1表达的抑制作用，与短链脂肪酸受体GPR41、GPR43 和GPR109a，以及调控IDO-1表达的转录因子SP1、AP1和PPARγ无关；④ 丁酸可降低STAT1表达，抑制IFN-γ/pSTAT1通路，从而发挥抑制IDO-1表达的作用；⑤ 丁酸还能通过其对组蛋白脱乙酰酶的抑制作用，减少IDO-1表达。
Butyrate Produced by Commensal Bacteria Down-Regulates () Expression a Dual Mechanism in Human Intestinal Epithelial Cells
2018-12-11, doi: 10.3389/fimmu.2018.02838
【主编评语】肠上皮表达的吲哚胺2,3-双加氧酶-1（IDO-1）受肠道菌群调控，但机制不明。Frontiers in Immunology上的一项研究发现，共生菌产生的丁酸可通过双重机制抑制IDO-1的表达。（@mildbreeze）
苏州大学儿童医院：早期生酮饮食对行为功能或无长期负面影响
Neuropsychiatry[IF:4.778]
① 生命早期饲喂生酮饮食（KD）对大鼠反射反应、海马苔藓纤维萌发、锌转运蛋白无影响，短期内负向趋地性反射延迟；② 每天饲喂KD后探索活动减少、梳理次数增加，比隔天饲喂组的记忆能力略强、脂代谢相关磷脂酶cPLA2增加；③ 与正常饮食相比，KD能减少海马体中载脂蛋白Apoa1、脱氢酶激酶Pdk4，增加载脂蛋白ApoE、膜联蛋白ANXN7和cPLA2，可能通过脂代谢信号通路对癫痫后的长期脑损伤起保护作用；④ 早期KD对大部分神经行为无长期不良影响。
Long-Term Neurobehavioral Status and the Metabolism-Related Gene Expressions in Healthy Rat Hippocampus Following a Ketogenic Diet
2018-12-01, doi: 10.4172/Neuropsychiatry.1000540
【主编评语】生酮饮食有助于治疗癫痫，但是否影响大脑功能并无定论。本研究利用幼年大鼠模型，检验生酮饮食对海马区和行为的影响，发现生酮饮食对大部分神经行为无长期不良影响，而生酮饮食涉及的脂代谢相关通路有望成为保护癫痫患者大脑的潜在靶标。（@小肠君）
热量限制的隔日禁食，可改善超重女性的体重和代谢
Obesity[IF:4.042]
① 88名超重妇女被随机分配到四种饮食组：IF70、IF100（每周进行3天摄入70%或100%热量的隔日间歇性禁食）、DR70（摄入70%热量的持续热量限制）和对照（摄入100%热量），干预8周；② 与DR70和IF100组相比，IF70组体重、脂肪量、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇和非酯化脂肪酸显著降低；③ IF100组比对照减掉更多的体重和脂肪，但空腹胰岛素升高；④ 胰岛素敏感性无组间差异，但24小时的禁食会暂时降低胰岛素敏感性。
Effects of Intermittent Versus Continuous Energy Intakes on Insulin Sensitivity and Metabolic Risk in Women with Overweight
01-01, doi: 10.1002/oby.22345
【主编评语】Obesity发表的一项小型临床试验，分析了不同禁食干预方法对超重女性的减肥、血脂和胰岛素等指标的影响，发现70%热量限制的隔日禁食比持续性热量限制效果更好，而非热量限制的隔日禁食除了减肥，没有改善代谢指标。（@mildbreeze）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，小歪，女巫，MAY DAY，兵兵
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