5文聚焦粪菌移植：疗效、标志物与影响因素 | 热心肠日报
今天是第2208期日报。
粪菌移植对IBS的长期疗效是怎样的？
Gastroenterology[IF:22.682]
① 一项粪菌移植（FMT）临床试验纳入125名IBS患者，38人移植自体粪便（对照），42人移植供体粪便30克，45人移植60克，分析FMT后第2、3年的菌群变化和治疗效果；② 三组的应答率在FMT后第2年和第3年时，分别为26.3%、69.1%和77.8%以及27.0%、64.9%和71.8%，治疗组应答率显著高于对照组；③ 治疗组的IBS症状和疲乏症状少于对照组，生活质量更高；④ 菌群失调指数仅在治疗组中降低，10个在FMT后含量改变的细菌分类群与疗效相关；⑤ 无长期不良事件。
Efficacy of fecal microbiota transplantation for patients with irritable bowel syndrome at three years after transplantation
06-13, doi: 10.1053/j.gastro.2022.06.020
【主编评语】粪菌移植（FMT）被探索用来治疗肠易激综合征（IBS）等疾病，此前研究表明精心筛选粪便供体或能在改善IBS症状上有较好效果（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1052536024）。Gastroenterology近期发表了该研究的后续随访数据，表明FMT对IBS的疗效可以长期持续，且安全性良好。（@mildbreeze）
湘雅二医院：粪菌移植或可安全有效地治疗系统性红斑狼疮
Journal of Autoimmunity[IF:7.094]
① 招募20名SLE患者进行粪菌移植，每周一次，连续三周，同时进行标准治疗，并随访12周；② 第12周时，SRI-4应答率为42.12%，无严重的不良事件；③ 与基线相比，SLEDAI-2K评分和血清抗dsDNA抗体水平显著降低；④ 干预后，短链脂肪酸产生菌显著富集，而炎症相关细菌分类群减少，同时肠道中的短链脂肪酸产生增加，外周血的IL-6水平及CD4+ 记忆T细胞/naive T细胞比值降低；⑤ SRI-4应答患者在粪菌移植前后均表现出特定的菌群特征。
Safety and efficacy of fecal microbiota transplantation for treatment of systemic lupus erythematosus: An EXPLORER trial
06-08, doi: 10.1016/j.jaut.2022.102844
【主编评语】中南大学湘雅二医院的陆前进团队与赵明团队在Journal of Autoimmunity上发表的一项临床试验结果，招募了20名对标准治疗应答不充分的系统性红斑狼疮（SLE）患者，在标准治疗的同时进行3次粪菌移植，干预12周后，患者的疾病评分、血清抗dsDNA抗体水平、肠道菌群组成等均得到了明显改善，且安全性良好。（@aluba）
FMT治疗溃疡性结肠炎的预测标志物（综述）
EBioMedicine[IF:8.143]
① 纳入25项研究进行系统评价，鉴定与粪菌移植（FMT）治疗溃疡性结肠炎的临床应答相关的供受体生物标志物；② 对FMT应答的患者中，FMT后梭菌目成员和拟杆菌属丰度及α多样性增加，产生短链脂肪酸是FMT成功的标志物；③ 与临床应答相关的供体因素包括：α多样性较高和含更多特定的拟杆菌属和梭菌纲成员；④ 与应答相关的患者基线特征包括：年龄小、疾病轻、病程短，菌群丰富度高、念珠菌属丰度高、与供体微生物谱相似性高。
Systematic review of donor and recipient predictive biomarkers of response to faecal microbiota transplantation in patients with ulcerative colitis
05-31, doi: 10.1016/j.ebiom.2022.104088
【主编评语】一些溃疡性结肠炎（UC）患者可对粪菌移植（FMT）产生应答，改善病情。EBioMedicine发表的一项系统综述，描述了或能预测FMT治疗反应的基线（FMT前）临床、菌群和代谢组生物标志物，有助于推动对UC患者进行FMT的精准医疗。（@mildbreeze）
用rrn长扩增子技术评估FMT治疗代谢综合征中的肠菌转移
Gut Microbes[IF:10.245]
① 使用rrn长扩增子（16S-ITS-23S）测序技术，检测4例供体及10例代谢综合征受试者FMT前后的肠道菌群；② FMT后受体菌群结构趋近供体；③ rrn相关SNVs核苷酸频率可评估供体菌株（粪副拟杆菌）在受体中的植入情况；④ FMT后多项临床指标改善，其中粪副拟杆菌与舒张压负相关，Alistipes shahii与粪便乙酸和丁酸丰度负相关；⑤ 一些供-受体配对的肠道菌群差异越大，对受体的代谢改善和菌群结构的影响越小，而女性受体和年轻供体与更好的疗效相关。
Species- and strain-level assessment using rrn long-amplicons suggests donor’s influence on gut microbial transference via fecal transplants in metabolic syndrome subjects
05-23, doi: 10.1080/19490976.2022.2078621
【主编评语】Gut Microbes近期发表的一项研究，采用基于纳米孔的rrn长扩增子测序，分析了粪菌移植（FMT）供体和受体的肠道菌群，发现供体菌群的植入在一定程度上与接受者的代谢健康的改善相关，而基线肠道菌群组成、性别和供体年龄等参数与FMT的疗效相关。（@mildbreeze）
坏死性小肠结肠炎粪菌移植供体-受体菌群动态
NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:7.29]
① 38只早产仔猪被随机分到对照组（CON）、无效供体（FMT1）、有效供体（FMT2）组，进行直肠粪菌移植；② 16S和宏基因组学分析供体和受体结肠菌群，发现只有FMT2受体仔猪坏死性小肠结肠炎（NEC）改善；③ 两个FMT组的微生物组成都发生了变化。但与FMT1相比，FMT2受体的乳酸杆菌相对丰度更高；④ 其中受体的罗伊氏乳杆菌和卷曲乳杆菌菌株与供体高度相似，表明移植成功；⑤ FMT2组具有更高的乳酸杆菌相对丰度，并含有特定的糖胺聚糖降解拟杆菌属。
Donor-dependent fecal microbiota transplantation efficacy against necrotizing enterocolitis in preterm pigs
06-09, doi: 10.1038/s41522-022-00310-2
【主编评语】坏死性小肠结肠炎(NEC)是一种影响早产儿的危及生命的炎症性肠病，其病理与肠道菌群失调有关。NPJ Biofilms and Microbiomes近期发表的文章，使用早产仔猪作为早产儿的模型，发现采用健康的哺乳仔猪作为供体，对新生早产仔猪进行粪菌移植（FMT）可以降低NEC风险。但其效应是供体特异性的。（@solo）
崔明+刘杏忠+李长清：用肠菌及代谢物辅助改善放疗预后
Journal of Advanced Research[IF:10.479]
① 在辐射损伤小鼠模型中，静脉注射免疫球蛋白（IVIg）仅能改善雌性小鼠的造血系统和胃肠道损伤，而对雄性小鼠效果不明显；② 腹部局部辐射诱导具有性别特异性的肠道菌群结构和代谢组改变，使毛螺菌科及其产物次黄嘌呤在雌性（而非雄性）小鼠肠道内富集；③ 机制上，次黄嘌呤上调肠道PLD1表达，增强IVIg的辐射保护作用；④ IVIg联用口服补充毛螺菌科或次黄嘌呤可显著缓解雄性小鼠的辐射损伤。
Sexual dimorphism in gut microbiota dictates therapeutic efficacy of intravenous immunoglobulin on radiotherapy complications
06-11, doi: 10.1016/j.jare.2022.06.002
【主编评语】静脉注射免疫球蛋白（IVIg）是一种用于治疗免疫缺陷和自身免疫疾病的制剂。中国医学科学院北京协和医学院崔明、李长清与南开大学刘杏忠及团队，近期在Journal of Advanced Research发表研究，探索了IVIg是否可以用来对抗辐射损伤，表明IVIg通过毛螺菌科/次黄嘌呤/PLD1轴，以一种性别特异的、肠道菌群依赖性的方式对抗辐射损伤。这些发现为改善癌症患者放疗预后提供了新思路。（@mildbreeze）
成人及儿童的腹痛相关肠-脑轴障碍的风险因素
Gastroenterology[IF:22.682]
① 纳入348项研究的结果，总结成人及儿童AP-DGBI的风险因素及保护性因素；② 女性、肠胃炎、被虐待经历、压力、心理障碍、躯体化障碍及睡眠质量差是成人及儿童AP-DGBI的一致风险因素；③ 在成人中，肥胖、吸烟及医疗资源使用增加是额外的AP-DGBI风险因素，社会支持及乐观主义是AP-DGBI的保护性因素；④ 无研究报道儿童AP-DGBI的保护性因素；⑤ 荟萃分析结果表明，在成人及儿童中，女性的AP-DGBI风险比男性分别高出56%及45%。
Risk Factors for Abdominal Pain Disorders of Gut Brain Interaction in Adults and Children: A Systematic Review
06-15, doi: 10.1053/j.gastro.2022.06.028
【主编评语】Gastroenterology上发表的一篇系统性综述，基于348项研究的结果，总结了成人及儿童的肠易激综合征（IBS）及腹痛相关的肠-脑互作障碍（AP-DGBI）的风险因素及保护性因素。（@aluba）
曹海龙+王邦茂：布拉氏酵母菌如何改善小鼠的IBS腹泻？
Pharmacological Research[IF:7.658]
① 肠上皮细胞体外实验发现，布拉氏酵母菌通过促进肝素结合表皮生长因子（HB-EGF）释放而激活表皮生长因子受体（EGFR），从而上调5-羟色胺转运体（SERT）表达；② 一致地，布拉氏酵母菌处理的腹泻型肠易激综合征（IBS-D）小鼠的肠道EGFR激活和SERT上调，降低了结肠5-HT水平，从而抑制肠道运动，改善了腹泻症状；③ 此外，布拉氏酵母菌改善了小鼠的肠道微生物群落组成，粪菌移植结果亦表明，布拉氏酵母菌可调节肠道菌群影响肠道运动。
Saccharomyces boulardii, a yeast probiotic, inhibits gut motility through upregulating intestinal serotonin transporter and modulating gut microbiota
06-08, doi: 10.1016/j.phrs.2022.106291
【主编评语】布拉氏酵母菌是一种广泛应用于各种消化系统疾病的真菌益生菌，包括肠易激综合征（IBS）。然而，布拉氏酵母菌缓解IBS的具体机制尚不清楚。近期天津医科大学总医院消化内科的曹海龙和王邦茂作为共同通讯作者发表于Pharmacological Research的一项动物研究发现，布拉氏酵母菌可通过激活EGFR上调SERT，并通过调节肠道菌群，最终抑制肠道运动改善IBS症状。（@广西妇幼保健院营养科陈彬林）
华南师大：人体肺部菌群与健康和疾病之间的隐秘关联（综述）
iMeta[IF:N/A]
① 痰液、肺泡灌洗液、支气管刷洗物及肺组织是获取肺部菌群的常规样本类型；② 肺部菌群广泛涉及于慢性呼吸系统疾病、急性呼吸系统疾病、肺癌等；③ 目前肺部菌群研究领域所面临的主要挑战包括微生物/宿主比例低，疾病异质性高，以及精准干预和培养手段的缺乏等；④ 肺部菌群研究的前景包括了解肺部菌群作为生物标志物在呼吸疾病诊断中的潜力，肺部菌群的空间动态性，肺部菌群与宿主的互作机制，以及肺部与远端器官之间的交互作用。
The human lung microbiome—A hidden link between microbes and human health and diseases
06-16, doi: 10.1002/imt2.33
【主编评语】目前，肺部菌群与宿主互作的确切机制仍不明确，肺部菌群领域存在许多技术与生物学挑战，以至需要量身定制检测及分析手段来突破这些瓶颈。在本综述中，作者总结概述了肺部菌群研究的原理与方法，回顾了现阶段已知的肺部菌群在人类疾病中所扮演的角色，着重突出机制层面的认识，讨论了肺部菌群领域所面临的挑战，并分享了其对这一领域未来研究的思路。作者希望该综述能够激发研究者对肺部菌群这一新兴领域更大的兴趣。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，danny，徐硕，芥末，aluba，广西妇幼保健院营养科陈彬林，刘永鑫-中科院-宏基因组
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