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细菌的功能基因如何上传NCBI获取GenBank号?
此前,我们已将讲解过如何将测序得到并拼接好的细菌16S rDNA序列上传至NCBI获取GenBank号。文章链接:还不知道如何将16S rRNA序列提交至NCBI获取Genbank号?我教你吖
(16S rDNA上传NCBI视频讲解如下)
2、数据提交进入的入口:gyrA基因的提交入口需要选择Submit中的第二个窗口,进去后选择Start BankIt Submission选项。
3、提交过程:进入后开始填写个人信息,然后根据提示一步一步往下填写,填写规则参照以上视频或者之前文章(注意:填写Nucleotide及Organism时需要点击两次continue)。提交过程中在Source Modifiers选项中提供提交序列的分离源等信息,如果是基因组上的基因直接按照下图进行填写就行(点击continue后需要进行信息核查)。下一步Features是整个提交过程中与16S提交存在最大区别的地方——需要提供提交序列编码的蛋白序列,可以提供两种方式进行提交:1)上传提前准备的FASTA格式文本;2)在线填写。
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