研究菌群与肝癌，对临床干预有什么启发？| 热心肠日报
今天是第865期日报。
NEJM：肠道细菌阻碍肝癌免疫应答会发生在人体中吗？
New England Journal of Medicine[IF:79.258]
① Ma团队的研究发现，用抗生素减少肠道梭菌属细菌可增加初级胆汁酸，通过增加肝窦内皮细胞表达CXCL16来抑制肝脏肿瘤，初级胆汁酸被梭菌属细菌代谢为次级胆汁酸后，对肝癌的免疫应答作用相反；② 虽然肝癌患者的CXCL16表达与初级胆汁酸存在相关性，但人类和小鼠的免疫系统、肠道菌群和胆汁酸的组成不同，Ma团队研究成果的临床意义有限；③ 单纯的饮食干预对减少肿瘤负荷的作用有限，应考虑开发针对特定细菌、胆汁酸受体的治疗手段。
Bile Acids, the Microbiome, Immunity, and Liver Tumors
08-30 DOI: 10.1056/NEJMcibr1807106
饮食如何影响菌群与心血管疾病（综述）
Journal of Nutrition[IF:4.398]
① 肠道菌群组成及其在肠道微环境中的初级和次级代谢产物与心脏代谢性疾病风险相关；② 饮食可以改变肠道环境和菌群，并为菌群代谢提供底物，因此评估不同类型的饮食模式与疾病之间的关联意义重大；③ 地中海式饮食指多吃水果蔬菜及海鲜坚果等清淡营养的食物，临床追踪试验也发现地中海式饮食或者素食主义有助于降低心脏代谢性疾病发生；④ 这种饮食方式有助于产生短链脂肪酸，减少三甲胺及次级胆酸生成；⑤ 健康饮食对于预防心血管疾病非常重要。
Dietary Patterns Affect the Gut Microbiome—The Link to Risk of Cardiometabolic Diseases
08-31 DOI: 10.1093/jn/nxy141
肠杆菌科帮助真菌调节小鼠的结肠炎
Microbiome[IF:9.133]
① DSS诱导的结肠炎小鼠使用万古霉素或粘菌素处理，并补充鲍氏酵母菌CNCM I-745或白色念珠菌；② 在未预先处理的小鼠中，鲍氏酵母菌可改善，而白色念珠菌可恶化DSS诱导的结肠炎；③ 在粘菌素处理后的小鼠中，鲍氏酵母菌或白色念珠菌无法调节结肠炎的严重程度；④ 相比于万古霉素处理的小鼠，粘菌素处理的小鼠中，细菌与真菌相对丰度的相关性显著下降；⑤ 使用粘菌素耐药性的大肠杆菌恢复肠杆菌科，可恢复真菌对结肠炎严重程度的调节。
Enterobacteriaceae are essential for the modulation of colitis severity by fungi
09-01 DOI: 10.1186/s40168-018-0538-9
鲍氏酵母菌缓解小鼠结肠炎，并改变肠道菌群及microRNA
Journal of Nutritional Biochemistry[IF:4.414]
① 小鼠分为2组，分别口服鲍氏酵母菌或PBS，持续26天，在第15天时开始使用DSS诱导结肠炎；② DSS引起结肠损伤，益生菌可显著缓解，表现为疾病活动指数（DAI）显著降低，结肠重量/长度显著改善；③ 同时，益生菌改变了结肠中的炎症标志物及上皮完整性相关蛋白的表达，并改变了microRNA的表达；④ 另外，益生菌还增加了肠道菌群中的细菌多样性，恢复了DSS引起的厚壁菌门/拟杆菌门比值变化。
Intestinal anti-inflammatory effect of the probiotic Saccharomyces boulardii in DSS-induced colitis in mice: Impact on microRNAs expression and gut microbiota ...
09-01 DOI: 10.1016/j.jnutbio.2018.08.005
海军医大+复旦等：结直肠肿瘤发生各阶段的菌群与炎症因子特征
BMC Microbiology[IF:2.829]
① 纳入130例初诊结直肠癌（CRC）患者，88例晚期结直肠腺瘤（A-CRA）患者，62例良性肠息肉患者和130例对照；② 四组的粪便菌群结构有显著差异，α多样性无明显差别；③ 鉴定出24种CRC相关细菌，内部具有显著关联性，且随对照-息肉-A-CRA-癌顺序而变；④ 血浆C反应蛋白和可溶性肿瘤坏死因子II在四组中有显著差异，随腺瘤-癌顺序而增加，部分CRC相关细菌与这两种炎症因子存在显著关联；⑤ 肠道菌群和炎症可能逐渐形成促CRC的微环境。
Changes in gut microbiota and plasma inflammatory factors across the stages of colorectal tumorigenesis: a case-control study
08-29 DOI: 10.1186/s12866-018-1232-6
抗抑郁药引起大肠杆菌的多重耐药性
Environment International[IF:7.297]
① 大肠杆菌K12暴露在不同浓度的氟西汀中，可增加突变频率，并增加对氯霉素、羟氨苄青霉素及四环素的耐药性；② 分离出对至少一种抗生素具有耐药性的突变菌株，发现一些菌株对氟喹诺酮、氨基糖苷类抗生素、β内酰胺、四环素及氯霉素产生了多重耐药性；③ 通过对转录组及蛋白组进行分析，发现AcrAB-TolC泵、YadG/YadH转运蛋白、Tsx通道及MdtEF-TolC泵共同触发了抗生素的外排；④ 全基因组分析揭示，ROS介导的突变上调了外排泵的表达。
Antidepressant fluoxetine induces multiple antibiotics resistance in Escherichia coli via ROS-mediated mutagenesis
08-18 DOI: 10.1016/j.envint.2018.07.046
PNAS：微流体法用于从菌群中高通量筛选新型抗生素
PNAS[IF:9.661]
① 利用微流体技术将棕熊口腔微生物个体和带有绿色荧光标记的金黄色葡萄球菌包裹，共培养之后使用流式细胞仪筛选能够抑制病原菌生长的菌株；② 筛选速度超快，达3万液滴/秒；③ 发现了肠球菌、魏斯氏乳酸菌和短小芽孢杆菌等具抑菌活性，这些菌株在使用传统方法筛选时未能发现，说明微液滴法达到了有效富集；④ 微流体结合多组学技术，进一步探讨了短小芽孢杆菌活性产物Amicoumacin A的合成和调控机制，发现它的活化与磷酸化过程密切相关。
Ultrahigh-throughput functional profiling of microbiota communities
09-04 DOI: 10.1073/pnas.1811250115
Lancet子刊：CagA活性Hp菌株疫苗无法预防Hp感染
The Lancet Gastroenterology and Hepatology[IF:N/A]
① 63名幽门螺旋杆菌（Hp）阴性的健康志愿者随机分为2组，分别接种细胞毒素相关抗原（CagA）活性Hp菌株（BCM 300）疫苗（36名）或安慰剂（27名）；② 选取其中的34名（19名疫苗、15名安慰剂）接受Hp感染；③ Hp感染后12周，32%的以苗族及40%的安慰剂组受试者仍为Hp阳性；④ 疫苗组的3种特异性抗体（CagA、空泡毒素A、中性粒细胞激活蛋白）平均浓度均显著高于安慰剂组；⑤ 相比于安慰剂，CagA活性菌株疫苗并无法提供对Hp感染的额外保护。
Efficacy, immunogenicity, and safety of a parenteral vaccine against Helicobacter pylori in healthy volunteers challenged with a Cag-positive strain: a randomised, placebo-controlled phase 1/2 study
07-02 DOI: 10.1016/S2468-1253(18)30125-0
感谢本期日报的创作者：花开，小胖子，沈志勋，玉龙潭，gaoch
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