解析遗传+菌群因素，为心血管个性化医疗铺路~ | 热心肠日报
今天是第878期日报。
傅静远等：调控心血管疾病相关蛋白的遗传-菌群互作
Nature Genetics[IF:27.125]
① 纳入1264人进行全基因组/宏基因组关联研究；② 分析的92种心血管疾病相关蛋白质中，血浆浓度与遗传和菌群因素相关的分别为73和41种，其中31种与二者皆相关；③ 遗传和菌群因素对蛋白浓度的影响大多存在叠加效应，总体上遗传的影响较大，二者可共同解释平均17.5%（1%-76.6%）的个体间差异；④ 遗传因素主要影响免疫相关蛋白，肠道菌群主要影响代谢和肠道健康相关蛋白；⑤ 鉴定出影响肠上皮功能、脂代谢和中枢神经系统功能的多个宿主-菌群互作。
Individual variations in cardiovascular-disease-related protein levels are driven by genetics and gut microbiome
09-24 DOI: 10.1038/s41588-018-0224-7
与BMI相关的肠道菌群及血浆代谢产物
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism[IF:5.789]
① 920名瑞典成年人根据身体质量指数（BMI）分为正常组、超重组和肥胖组，对血浆的48种代谢产物进行定量分析，并对其中674名参与者的粪便菌群进行分析；② BMI与19种代谢产物相关，其中谷氨酸盐与BMI的正相关性最为显著；③ 另外，支链氨基酸及相关代谢产物的水平也与BMI呈正相关，而丝氨酸、天冬酰胺、苏氨酸和柠檬酸则与BMI呈负相关；④ 3个菌属（瘤胃球菌属、Blautia、Dorea）的相对丰度与BMI呈正相关，SHA-98菌属则与BMI呈负相关。
Connection Between BMI-Related Plasma Metabolite Profile and Gut Microbiota
04-01 DOI: 10.1210/jc.2017-02114
口腔及肠道菌群在类风湿关节炎发病机制中的作用（综述）
FEMS Microbiology Reviews[IF:11.392]
① 口腔和肠道菌群的变化，引起自身抗原的耐受性缺失，促进关节损伤的炎症增加，是类风湿关节炎（RA）的主要病因；② RA中，人体与菌群的相互作用，与生物膜的形成和中性粒细胞的功能相关；③ 牙龈卟啉单胞菌、伴放线聚生杆菌等口腔致病菌可介导瓜氨酸化蛋白的产生，从而促进抗瓜氨酸化蛋白抗体（ACPA）的产生；④ 肠道菌群失调后，某些特定菌种过度生长可促进Th1细胞的应答，脆弱拟杆菌的生长受到抑制可抑制Treg的活化，最终可导致免疫失衡。
Talk to your gut: the oral-gut microbiome axis and its immunomodulatory role in the etiology of rheumatoid arthritis
09-14 DOI: 10.1093/femsre/fuy035
四川大学：小檗碱或可调节菌群改善牙周骨质流失
Journal of Dental Research[IF:5.38]
① 在切除卵巢（OVX）大鼠中建立实验性牙周炎模型，OVX-牙周炎大鼠用小檗碱处理7周；② 与对照组大鼠相比，小檗碱处理的大鼠牙槽骨丢失显著减少，骨代谢显著改善；③ 同时，肠道中丁酸产生菌增多，肠道屏障完整性得到改善，细胞旁路通透性降低；④ 小檗碱处理减弱了大鼠的IL-17A相关免疫应答，同时降低了血清中的促炎因子水平，显著减少了牙槽骨中的IL-17A+细胞；⑤ 小檗碱或可通过调节肠道菌群治疗雌激素缺乏引起的牙周骨流失。
Berberine Ameliorates Periodontal Bone Loss by Regulating Gut Microbiota
09-10 DOI: 10.1177/0022034518797275
Nature子刊：母亲对婴儿肠道菌群抗生素耐药性的影响
Nature Communications[IF:12.353]
① 分析16对母婴的粪便和母乳样本，评估出生6个月内，母亲肠道/母乳菌群对婴儿肠道菌群中抗生素耐药性的影响；② 婴儿肠道和母乳中均含有高水平的抗生素耐药基因（ARG）和可移动遗传元件（MGE），母亲肠道和母乳菌群中的部分ARG和MGE可传递给婴儿；③ 婴儿粪便中，耐药组和MGE的组成与菌群组成密切相关，ARG丰度与大肠杆菌正相关、与双歧杆菌属负相关；④ 母亲分娩期抗生素治疗和提前终止母乳喂养，均与婴儿粪便菌群中特定ARG的丰度增加相关。
Maternal gut and breast milk microbiota affect infant gut antibiotic resistome and mobile genetic elements
09-24 DOI: 10.1038/s41467-018-06393-w
Cell：用多组学描绘生命早期的免疫系统发育
Cell[IF:31.398]
① 生命早期的经历对免疫系统有长远影响，但样品获取的难度阻碍了该阶段的研究；② 以节约样品的分析方法为突破，Olin等人用多组学技术，分析了婴儿出生至6月龄免疫系统的动态发育变化；③ 新生儿的整体免疫情况，在细胞、基因转录和菌群等方面具有明显个体差异，但在3月龄时开始汇合一致，趋于与父母相近；④ 提示出生后3个月是关键的窗口期，多种环境和遗传因素参与塑造婴儿免疫系统；⑤ 研究填补了婴儿免疫发育的空白，为深入研究打下铺垫。
Neonate-omics: Charting the Unknown Immune Response in Early Life
08-23 DOI: 10.1016/j.cell.2018.08.001
生命早期摄入n-PUFA或降低临床前期1型糖尿病风险（综述）
European Journal of Clinical Nutrition[IF:2.954]
① 纳入3项前瞻性队列研究和4项病例对照研究，分析妊娠期或生命早期摄入多不饱和脂肪酸（PUFA）与后代儿童1型糖尿病（T1D）风险之间的关联；② 妊娠期摄入n-3 PUFA对儿童临床前期T1D的相对风险无显著影响，生命早期摄入n-3 PUFA的儿童有着较低的临床前期T1D的相对风险；③ 儿童补充n-3 PUFA与临床T1D风险无关，摄入n-6 PUFA与临床前期或临床T1D风险亦无关；④ 结果仅支持生命早期摄入n-3 PUFA或降低儿童临床前期T1D的风险，需前瞻性研究验证。
Intake of polyunsaturated fatty acids and risk of preclinical and clinical type 1 diabetes in children-a systematic review and meta-analysis
05-16 DOI: 10.1038/s41430-018-0185-z
Cell子刊：食管类器官模型用于研究食管发育及相关疾病
Cell Stem Cell[IF:23.29]
① 鼠与人食管组织结构不同，难以用其建模；② 通过短时操纵早期内胚层和前肠模式信号，使多能干细胞定向分化为人食管类器官（HEO），为研究食管发育和疾病提供模型；③ HEO发育与小鼠食管组织相似，均含基底层祖细胞和复层鳞状上皮，且前者可分化补充后者，但这种能力有限；④ HEO模拟前肠发育，研究在背-腹轴及食管特化中由Sox2调控的分子通路；⑤ 发现Sox2通过抑制前肠背侧的Wnt信号并限制其腹侧Nkx2-1表达，在食管特化中发挥重要作用。
Esophageal Organoids from Human Pluripotent Stem Cells Delineate Sox2 Functions during Esophageal Specification
09-20 DOI: 10.1016/j.stem.2018.08.008
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，卓求，MAY DAY，祁玉丽，罗本，药农，莘枳
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